Systems for Genome Sequencing

次世代シーケンサにより大量の生ゲノムデータが得られる中、その効率的な処理に焦点をあてて研究を行っています。ハイスループットシーケンサから得られるショートリードに加え、近年発展が進むNanoporeなどのロングリードシーケンサを対象に、計算強度の高いアライメントやアセンブリといった二次処理から、ベースコーラーやウイルス検出に用いられる機械学習のフレームワークまで、多面的な研究をしてます。